Protein–RNA interactions for Protein: Q5D525

Syce1l, Synaptonemal complex central element protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1lQ5D525 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Syce1lQ5D525 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms