Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKS4

Eri2, ERI1 exoribonuclease 2, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri2Q5BKS4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eri2Q5BKS4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Eri2Q5BKS4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms