Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Znf354cQ571J5 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Znf354cQ571J5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms