Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Urb1Q571H0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Urb1Q571H0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Urb1Q571H0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Urb1Q571H0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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