Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf608Q56A10 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf608Q56A10 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf608Q56A10 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms