Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Lrig2Q52KR2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms