Protein–RNA interactions for Protein: Q505G4

Rtl6, Retrotransposon Gag-like protein 6, mousemouse

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl6Q505G4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Rtl6Q505G4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rtl6Q505G4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rtl6Q505G4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rtl6Q505G4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rtl6Q505G4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Rtl6Q505G4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Rtl6Q505G4 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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