Protein–RNA interactions for Protein: Q505D7

Opa3, Optic atrophy 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opa3Q505D7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Opa3Q505D7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Opa3Q505D7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms