Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Otol1Q4ZJM7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Otol1Q4ZJM7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms