Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Snx33Q4VAA7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx33Q4VAA7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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