Protein–RNA interactions for Protein: Q4U2R1

Herc2, E3 ubiquitin-protein ligase HERC2, mousemouse

Predictions only

Length 4,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc2Q4U2R1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Herc2Q4U2R1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
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