Protein–RNA interactions for Protein: Q499E0

Brinp3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brinp3Q499E0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brinp3Q499E0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Brinp3Q499E0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms