Protein–RNA interactions for Protein: Q3V118

Ccdc185, Coiled-coil domain-containing 185, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc185Q3V118 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ccdc185Q3V118 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ccdc185Q3V118 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms