Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnpc3Q3UZ01 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms