Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYV8

Dnaaf3, Dynein assembly factor 3, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnaaf3Q3UYV8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Dnaaf3Q3UYV8 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Dnaaf3Q3UYV8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms