Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc160Q3UYG1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms