Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Kdm5aQ3UXZ9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Kdm5aQ3UXZ9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms