Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Capn13Q3UW68 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms