Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTQ7

Prdm10, PR domain zinc finger protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm10Q3UTQ7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Prdm10Q3UTQ7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prdm10Q3UTQ7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms