Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Syndig1lQ3USQ7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms