Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fchsd2Q3USJ8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms