Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
E130208F15RikQ3UPV3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms