Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tmem253Q3UNB8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmem253Q3UNB8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms