Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Lrch2Q3UMG5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lrch2Q3UMG5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms