Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cobll1Q3UMF0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cobll1Q3UMF0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms