Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc33Q3ULW6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc33Q3ULW6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms