Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ctsll3Q3ULP7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ctsll3Q3ULP7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms