Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CrxosQ3UL53 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CrxosQ3UL53 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms