Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ell2Q3UKU1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ell2Q3UKU1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms