Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Usp19Q3UJD6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Usp19Q3UJD6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms