Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cnep1r1Q3UJ81 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cnep1r1Q3UJ81 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cnep1r1Q3UJ81 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms