Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm648Q3UJ22 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm648Q3UJ22 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm648Q3UJ22 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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