Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIW8

Rnf224, RING finger protein 224, mousemouse

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf224Q3UIW8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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Rnf224Q3UIW8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Rnf224Q3UIW8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Rnf224Q3UIW8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rnf224Q3UIW8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Rnf224Q3UIW8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rnf224Q3UIW8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms