Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lmod2Q3UHZ5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Lmod2Q3UHZ5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms