Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHB8

Ccdc177, Coiled-coil domain-containing protein 177, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc177Q3UHB8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc177Q3UHB8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc177Q3UHB8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms