Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rrp36Q3UFY0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rrp36Q3UFY0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms