Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Garem1Q3UFT3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms