Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Yipf3Q3UDR8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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