Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Trafd1Q3UDK1 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms