Protein–RNA interactions for Protein: Q3U435

Mmp25, Matrix metalloproteinase-25, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp25Q3U435 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mmp25Q3U435 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms