Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3E2

Fam117b, Protein FAM117B, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam117bQ3U3E2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ifna16-201ENSMUST00000105148 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 4833412K13Rik-201ENSMUST00000195509 1479 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ackr1-202ENSMUST00000194046 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ccdc54-201ENSMUST00000062439 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm26722-201ENSMUST00000181237 1048 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Fam117bQ3U3E2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Fam117bQ3U3E2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms