Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sec24aQ3U2P1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sec24aQ3U2P1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms