Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pag1Q3U1F9 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms