Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tmem35bQ3U0Y2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms