Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Palb2Q3U0P1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Palb2Q3U0P1 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms