Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Trappc9Q3U0M1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Trappc9Q3U0M1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms