Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

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Length 142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbq1bQ3U0A6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbq1bQ3U0A6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbq1bQ3U0A6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbq1bQ3U0A6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hbq1bQ3U0A6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Hbq1bQ3U0A6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Hbq1bQ3U0A6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Hbq1bQ3U0A6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hbq1bQ3U0A6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Hbq1bQ3U0A6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Hbq1bQ3U0A6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms