Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cdkl4Q3TZA2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cdkl4Q3TZA2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms