Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Srsf6Q3TWW8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Srsf6Q3TWW8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms