Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc136Q3TVA9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc136Q3TVA9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms